Saison 1

Gon Freecs est un jeune orphelin qui vit avec sa tante Mito Freecs et sa grand-mère. Au cours d'une escapade en forêt, il tombe né-à-né avec un monstre.

Au port de l'île Baleine, Gon cherche le bateau censé le conduire là où se déroulera l'examen. Alors qu'il parcourt la ville, il rencontre Leorio.

À bord du bateau, Gon vogue en direction de l'île Dole, où va se dérouler l'examen des Hunters.

Gon, Kurapika et Leorio sont arrivés sur l'île Dole, et doivent chercher l'endroit exact où se déroulera l'examen. Leorio choisit de prendre un bus censé aller à Zaban City, mais celui-ci s'avère être un piège.

Après avoir réussi le quiz, Gon et ses compagnons se mettent à la recherche de navigateurs, qui peuvent les conduire précisément là où se déroule l'examen.

Peu après, Satotsu, le Hunter examinateur, se présente aux candidats et annonce le déroulement la première épreuve : il s'agit de rejoindre le lieu de l'épreuve suivante à pied.

Dans le tunnel, Leorio est en proie à des hallucinations. On découvre alors qu'il souhaite devenir Hunter afin de pouvoir réaliser son rêve : devenir médecin.

L'homme blessé tente de convaincre les candidats de le suivre, mais se fait tuer d'un seul coup par Hisoka, qui confirme que Satotsu est le véritable examinateur.

La deuxième épreuve commence. Les candidats doivent cuisiner deux plats afin de satisfaire le goût des deux Hunters gourmets, Buhara et Menchi.

Menchi déclare la fin de l'épreuve, et tous les candidats sont recalés. Devant les protestations de ceux-ci, le comité d'organisation de l'examen des Hunters se rend sur place.

À bord du dirigeable du comité d'organisation, les candidats ont quartier libre. Alors qu'ils explorent le dirigeable, Gon et Killua rencontrent Anita, une candidate ayant échoué à la deuxième épreuve.

Killua et Gon essayent de reprendre la balle des mains de Netello, mais ils sont complètement désemparés. Après un moment, Killua abandonne, car ses pulsions meurtrières font surface.

Les candidats ont 72 heures pour descendre au pied de la tour. Après avoir cherché une porte d'entrée, le groupe tombe sur le chemin du « choix de la majorité ».

Sedokan offre à Gon le choix entre deux bougies, et de voir laquelle brûlera le plus longtemps.

Ailleurs dans la tour, Hisoka combat un adversaire et est le premier à atteindre l'arrivée. Pendant ce temps, Leorio s'impatiente et souhaite confirmer la mort de Majitani.

La jeune femme parvient à affaiblir psychologiquement Leorio, et remporte le quatrième match.

Après avoir traversé plusieurs salles, le groupe se trouve face à la dernière porte du chemin, et doit choisir entre un chemin court mais accessible trois d'entre eux, ou long accessible à tout le monde.

Les candidats sont amenés par dirigeable sur une île où se trouve un bateau encastré dans la roche faisant office d'hôtel.

Plusieurs heures passent sans que les réceptionnistes ne reviennent. Après avoir cherché dans le bateau, Kurapika découvre que cette île fait partie de l'épreuve.

Les candidats restés sur le bateau comprennent qu'ils n'ont que 24 heures avant que la deuxième vague ne submerge l'entièreté de l'île, et le bateau avec.