Saison 3

Un trio de vieux super-méchants retraités reprennent leurs méfaits, et les filles doivent convaincre un super-héros retraité et son acolyte de reprendre leur service contre le mal.

Bulle et Rebelle ayant accidentellement coupé les cheveux de Belle, celle-ci reçoit les brimades de ses sœurs et de tous les habitants de Townsville.

Les filles et le Professeur emménagent dans une ville appelée Cityville, et les filles veulent offrir leur aide à la ville ; cependant, les dégâts qu'elles ont causées en arrêtant deux voleurs vont leur coûter cher.

Mojo Jojo est appelé pour surveiller les filles pendant une nuit.

L'une des expériences du Professeur Utonium échoue, et tous les habitants de la ville se retrouvent avec un corps différent.

Bulle ne pouvant pas frapper correctement une fourmi géante attaquant la ville, ses deux sœurs l'emmènent voir le Professeur pour un examen. Elle s'avère souffrir d"une sévère myopie et doit porter des lunettes au risque d'être brimée par Belle et Rebelle.

Le père de Princesse achète Townsville, et Princesse décide de légaliser le crime et corrompe les forces de l'ordre.

C'est au tour de Mitch de s'occuper de Twiggy, le hamster de la classe, mais les Supers Nanas n'ont pas confiance et décident de le suivre.

Mike Brokowski est l'un des pires policiers de Townsville. Il est renvoyé de son poste pour cause de flemmardise ; il accuse les Supers Nanas de son renvoi et compte bien se venger d'elles.

Un gigantesque et indestructible monstre fait son apparition dans Townsville. Belle utilise la réflexion, et Rebelle la force brute pour essayer d'en venir à bout. Néanmoins, la douce personnalité de Bulle parvient à convaincre le monstre de partir.

Dans cette suite de l'épisode Les Joyaux d'Anubis, Mojo Jojo vole une nouvelle fois les Joyaux et la tête d'Anubis réparées pour changer le monde en chien. Cette fois, il a pris toutes les précautions nécessaires pour empêcher de se faire mordre au derrière comme la dernière fois. Cependant, son plan échoue encore par les supers nanas.

Un voleur réussit à s'emparer d'un diamant et à échapper aux Supers Nanas ; néanmoins, il le fait accidentellement tomber dans une boite de céréales dans une usine. Cette boîte atterrit dans la maison des Supers Nanas, et il tente tout pour le récupérer, y compris même de se déguiser en leur mascotte préférée.

Les filles tentent de copier la personnalité de leurs héroïnes préférées de comics. Elles ne parviennent cependant pas à sauver Townsville.

Les filles obtiennent une récompense à chaque fois qu'elles sauvent la ville : des bonbons. Cependant, les choses tournent mal lorsqu'elles en veulent toujours plus.

Les filles combattent un blob géant, apparemment insensible à leurs attaques. Lorsqu'elles s'aperçoivent qu'ils cherchent le chat qu'il a perdu, elles le retrouvent et le blob quitte Townsville.

Le maire décide de veiller sur sa ville après avoir été sévèrement critiqué par sa femme de ménage. Lui et mademoiselle Bellum embarquent alors dans une montgolfière. Cependant, il cause beaucoup plus de dégâts en procédant de cette manière.

Les filles se réveillent pendant plusieurs nuits consécutives entourées de jouets. Ces jouets, qui leur ai donnés par le Professeur souffrant de somnambulisme, sont en réalité volés la nuit dans un magasin.

Un petit bonhomme suce les informations depuis le cerveau des habitants de Townsville.

Une super-vilaine et féministe radicale nommée Femme Fatale enseigne aux filles la manière dont les hommes contrôle les femmes.

À chaque fois que le professeur planifie de faire quelque chose avec les filles, elles doivent partir en mission. Elles lui manquent alors il décide de se fabriquer un super costume pour pouvoir les accompagner en mission. Mais, le professeur est si protecteur qu'il fait honte aux Supers Nanas.