Saison 1

Le supercalculateur XANA vient de lancer une nouvelle attaque contre la planète Terre. Cette fois, il a pris le contrôle de l'ours en peluche de la jeune Milly.

Alors qu'Odd tente de monter un groupe de musique, XANA prend le contrôle du réseau électrique qui alimente le collège.

Jérémie a trouvé le moyen de se faire coller pendant les vacances scolaires pour être là au cas où XANA déciderait de lancer une nouvelle attaque.

Sissi se sert du journal intime d'Ulrich, qui contient des détails sur ses activités secrètes, pour l'obliger à s'intéresser à elle.

XANA a créé un virus informatique qu'il a diffusé sur Internet. Toutes les bases de données de la ville sont perturbées.

Quand le proviseur décide d'agrandir le gymnase, XANA ne perd pas de temps pour transformer les bulldozers du chantier en armes.

Yumi disparaît puis réapparaît, inconsciente, dans l'un des scanners de l'usine. Jérémie, Ulrich et Odd décident alors de l'emmener à l'infirmerie.

Un réalisateur de cinéma envisage de tourner son prochain film dans l'usine. Mais que se passera-t-il s'il découvre le laboratoire, le supercalculateur et Lyoko ?

En plein cours de sciences, les téléphones portables de tous les élèves se mettent à sonner. Quand ils décrochent, il n'y a personne au bout du fil.

La nouvelle élève qui arrive au collège est le portrait craché d'Aelita. Imaginez la surprise de nos héros !

Jérémie a un gros problème : il est trop intelligent. Ses professeurs pensent qu'il devrait être transféré dans un lycée réservé aux surdoués.

Après avoir reçu une lettre, Ulrich prend son courage à deux mains et avoue ses sentiments à Yumi, mais il n'obtient pas la réaction qu'il espérait.

Après une autre tentative infructueuse de Jérémie pour donner vie à Aelita, le programme informatique de la jeune fille virtuelle se met à bugger.

L'usine déserte retrouve un nouveau souffle quand XANA en investit chaque rouage.

Yumi va mal, car ses parents, d'habitude si proches, ont décidé de se séparer le temps de faire le point.

Un nouvel élève débarque au collège. Il s'intéresse aussitôt à Sissi, mais Hervé ne l'entend pas de cette oreille.

En utilisant un nouvel appareil du laboratoire du collège, XANA parvient à créer des nanovirus, de minuscules machines capables d'attaquer la mémoire du cerveau humain.

Laissé seul dans sa chambre, Odd entre dans un état de transe étrange, puis cesse de bouger. Le lendemain, Sissi subit le même sort.

Après s'être disputé avec Aelita, Jérémie décide d'aller sur Lyoko en personne pour retrouver son amie et lui demander pardon.

Alors que XANA a pris le contrôle de la chaîne de montage de l'usine déserte, les robots d'Hervé et de Jérémie s'affrontent dans le gymnase.