Saison 2

À la recherche de financement pour ISIS, Malory entraîne ses agents contre leur gré à la station de ski Gstaad afin qu'ils protègent la fille d'un Suisse milliardaire.

Archer et ses collègues passent à l'action pour empêcher Malory, qui a perdu tout son argent suite à une escroquerie, de vendre l'agence à ODIN.

Archer a la surprise de sa vie lorsque son escorte préférée, Trinette, se présente à ISIS accompagnée d'un bébé débordant de vie.

L'agence envoie Archer et Lana dans les zones marécageuses de la Louisiane pour protéger un gazoduc contre un écoterroriste déterminé à le détruire.

Woodhouse craint le pire lorsque des membres de son ancien escadron de la Première Guerre mondiale (les célèbres Double Deuce) commencent à mourir de façon mystérieuse.

Dans l'espoir de perdre sa réputation de loser, Cyril déploie secrètement un virus dans les ordinateurs de l'agence afin de le détruire et de pouvoir jouer les héros.

Une actrice voulant se documenter pour un rôle accompagne les agents, mais son statut de star exacerbe les relations névrotiques qu'entretiennent les membres de l'agence.

Quand il découvre qu'il doit être opéré pour son cancer du sein, Archer essaie de faire la paix avec Lana et avec ses autres collègues de l'agence.

Lorsque Archer découvre que les médicaments de chimiothérapie pour son cancer sont contrefaits, il se lance à la poursuite des criminels derrière ce stratagème.

Lorsque des kidnappeurs prennent Pam pour Cheryl/Carol, l'agence passe en sécurité maximale et l'équipe découvre quelque chose de surprenant sur Cheryl/Carol.

Les agents se rendent à Monaco pour payer un maître-chanteur, mais Archer perd tout l'argent au jeu et l'équipe essaie tant bien mal de le récupérer.

La quête d'Arthur pour découvrir l'identité de son père le mène derrière le rideau de fer... et en eaux troubles !

Les soupçons et la jalousie sont omniprésents à ISIS alors qu'un projet secret du docteur Krieger arrive à terme et qu'Archer revient avec un ancien agent du KGB.