Saison 1

Doremi entre dans une boutique de magie et aperçoit une sorcière du nom de Maggie Grigri. En disant malencontreusement qu'elle est une sorcière, Maggie Grigri se change en grenouille. Pour réparer son erreur, Doremi doit devenir une sorcière pour rendre à Maggie Gigri son apparence normale.

Émilie, la meilleure amie de Dorémi, envie terriblement son amie (c'est réciproque). Dorémi, voulant utiliser ses pouvoirs magiques, décide de transformer Emilie en Dorémi et Dorémi en Emilie. Il va s'avérer que la vie de l'une comme de l'autre est bien différente...

Une nouvelle élève nommée Sophie originaire d'Osaka est transférée dans la classe de Doremi. Lorsque Doremi la connaît un peu mieux, celle-ci se lie d'amitié avec Sophie.

Émilie et Sophie découvrent le secret de Doremi, comme quoi elle est une apprentie-sorcière; elles deviennent à leur tour des apprenties-sorcières. Les trois jeunes filles redécorent la boutique après que Doremi l'a malencontreusement détruite.

Après avoir redécoré et renommé leur boutique de magie, les filles attendent leur premier client et une sorcière du nom de Délia vient leur rendre visite. Les filles ouvrent enfin le Maho. Mais les clients se font attendre… Le jeune François Tetsuya entre dans la boutique et achète un porte-bonheur, mais Maggie Grigri annonce ensuite aux apprenties qu’il n’a aucun pouvoir magique. Dorémi va donc tout faire pour aider son ami à régler son problème, sans que celui-ci ne se doute de rien.

Sophie se fait une amie : Nathalie. Celle-ci commence à lui mentir au sujet de son père. Sophie découvre la vérité et s'énerve. Les filles vont tenter de réconcilier les brouillées grâce à la magie...

Les trois jeunes filles se préparent à passer leur premier examen, mais Doremi doit passer la journée à garder sa petite sœur Bibi. Bibi, quant à elle, voudrait prendre le train pour rendre visite à ses grands-parents.

Après avoir échoué à l'examen de niveau 1, Doremi a l'occasion de passer un examen de rattrapage qui s'annonce très difficile.

Dorémi a réussi son examen et obtient une fée: Dodo. La fée et la sorcière s'embrouillent et Dodo s'enfuit...

Mademoiselle Kiki ayant découvert des photos compromettantes, elle et le principal adjoint rendent visite à la soi-disant grand-mère de Sophie à la boutique de magie.

Après avoir été insultée par Thomas, Marina refuse de prendre soin des fleurs plantées devant l'école. Émilie est déterminée à aider Marina avec bien évidemment de Sophie et de Dorémi.

Un jeune petit frère échange son t-shirt fétiche pour acheter un porte-bonheur et porter chance à son grand frère qui joue au football.

Les filles passent à l'examen de niveau 2 dans lequel elles doivent courir un parcours d'obstacle en trois heures.

Naomi est insultée par le SOS Trio car elle est grande et plus forte que les autres filles de son âge.

Maggie Grigri a été achetée par Bibi. Bibi traite Maggie Grigri comme une peluche et l'emmène à l'école.

Le père de Doremi l'emmène elle et ses amies pour pêcher avec un jeune garçon qui partage sa passion.

Maxime a été arrêté et personne d'autre ne croit à son innocence à part Émilie et mademoiselle Kiki. Avec la place de mademoiselle Kiki en jeu, Doremi, Émilie et Sophie vérifient à l'aide de leur magie si son arrestation est justifiée.

Lors d'un examen, Émilie utilise la magie pour soigner un animal, mais elle n'en a pas le droit. La reine lui interdit alors de pratiquer la magie pendant 10 jours.

Durant son dernier jour sans magie après avoir transgressé les lois du monde magique, Émilie est enlevée par deux malfaiteurs et seules Doremi et Sophie peuvent la sauver.

Maggie Grigri perd sa boutique face à Délia lors d'un jeu de cartes.