Saison 2

L'équipage de Moya a échappé de justesse à la mort grâce à Crais, mais se retrouve perdu dans un champ d'astéroïdes...

Ayant entendu des histoires sur un autre Luxan, D'Argo pousse ses équipiers à le rechercher. Cette quête se termine lorsqu'ils trouvent Nilaam, une Luxane, sur le point de mourir...

Chiana est effondrée lorsqu'elle apprend le décès d'un de ses proches. Elle se réfugie sur une «planète-cimetière» où elle rejoint un groupe de jeunes aliens anti-conformistes...

L'équipage revient d'une planète commerciale avec un chargement de crackers et accompagné d'un alien nommé de Traltixx. Celui-ci leur promet de modifier Moya afin qu'ils ne se fassent plus repérer par Scorpius. Mais Crichton ne lui fait pas confiance...

Une cassette vidéo compromet Aeyrn. L'officier Sun est directement impliquée dans le meurtre de l'ancien pilote de Moya...

L'équipage est effrayé lorsque Chiana revient à bord du vaisseau et dresse un tableau de l'avenir. Un par un, les membres de l'équipage semblent mourir dans des circonstances plutôt étranges...

Les vivres commencent à manquer, ce qui a des effets inquiétants sur Zhaan. Chiana décide d'amener Moya près d'une «entreprise minière» située dans l'espace sur le squelette d'une énorme créature morte qu'elle a jadis fui..

Zhaan et Crichton se retrouvent coincés dans leur vaisseau qui est tombé en panne. Ils attendent que Moya vienne les chercher. Zhaan fait des cauchemars : elle se rappelle l'époque où Aeryn, Crichton et D'Argo avaient disparus et où elle pensait qu'ils étaient tous morts...

Un vaisseau endommagé menace d'attaquer Moya. Les deux aliens qui se trouvent à bord affirment avoir été attaqués par Talon. Ils font feu sur Moya, et bien qu'une bonne partie de l'énergie soit déviée, le vaisseau est touché. Tous les passagers se retrouvent dans le corps d'un autre...

Un envahisseur extraterrestre capture Crichton dans une sphère verte et trois Crichton différents sont créés : le Crichton homme des cavernes, le Crichton actuel et le Crichton du futur, qui a l'apparence d'un lézard. La sphère, qui attire Moya dans un vide transdimensionnel, veut emporter un des Crichton avec elle...

Moya découvre une colonie perdue. Un couronnement a lieu et l'équipage, excepté Zhaan, descend sur la planète pour y assister. Avant d'accéder au trône, la princesse doit trouver quelqu'un avec un ADN compatible, qui deviendra son mari... Crichton est le seul à avoir un ADN identique à celui de la princesse...

La fiancée du Prince, qui est en réalité un agent secret, sauve la vie de Crichton. Ce dernier se retrouve face à un choix difficile : épouser la princesse et être transformé en statue pour les quatre vingt prochaines années ou redevenir le prisonnier de Scorpius...

La tête de la statue de Crichton a disparu. Zhaan découvre que la mort de Moya n'était en fait qu'un test pour savoir si elle était vraiment apte à la piloter. Aeryn fait de l'escalade avec Dregon. Mais les choses tournent mal lorsque celui-ci panique et entraîne Aeryn dans sa chute...

L'équipage vient de se procurer de la nourriture, mais le bruit court qu'elle pourrait contenir un parasite. Afin d'écarter tout danger, Chiana achète un petit alien tueur de parasites. Crichton a des hallucinations sur Scorpius. D'Argo est attaqué par une étrange créature...

Crichton se réveille dans un hôpital, sur la Terre. Ses amis et sa famille lui disent que toute l'aventure qu'il a vécue n'était qu'un rêve. Mais il commence à avoir des doutes en voyant ses amis arriver dans des rôles inhabituels. Il est alors persuadé qu'il est victime d'un piège tendu par Scorpius...

L'équipage traverse une brume stellaire. Aeryn décide d'aller étudier le phénomène de plus près. De retour sur le vaisseau, elle est devenue une vieille femme. Elle parle à ses amis de la vie qu'elle a vécue et des enfants qu'elle a eus. Crichton retourne avec elle sur la planète et subit la même transformation. Ils ne peuvent plus repartir sur Moya qui se trouve coincée dans une région ou le temps s'écoule lentement...

Crais demande à l'équipage de Moya de l'aider à diminuer la puissance du canon de Talyn. Dans la minute qui suit, Talyn détruit un vaisseau de commerce. Alors qu'un second vaisseau approche, Crais et Talyn s'enfuient. L'équipage de Moya est arrêté et apprennent qu'ils vont tous être jugés pour l'accident...

L'équipage est capturé par des agents Nebari qui veulent emmener Chiana avec eux. Toutes les personnes à bord subissent un lavage de cerveau, et les Nebaris informent Chiana que son frère est toujours en vie. Ils cherchent en réalité à obtenir des informations sur lui car il est devenu le chef d'un groupe de résistants...

Par miracle, Stark est retrouvé vivant. D'Argo veut sauver son fils et Stark lui apprend qu'il doit être vendu aux enchères comme esclave. D'Argo s'y rend seul et se fait arrêté. L'équipage se rend sur la planète pour le libérer, et Rygel en profite pour voler des lingots qui appartiennent à Scorpius...

Les membres de l'équipage arrivent trop tard : Scorpius a survécu et a acheté le fils de D'Argo, et il est prêt à l'échanger contre Crichton. Moya est attaquée par d'énormes araignées, et le seul moyen de s'en débarrasser est de les brûler, mais Moya risque d'être sérieusement endommagée...