Saison 1

Comment Fujiko Mine a rencontré Arsène Lupin III pour la première fois. Fujiko est en mission d'infiltration d'un trafic de drogue, ce qui n’est pas facilité par l’arrivée du maître voleur Lupin.

Après avoir perdu de fortes sommes contre une veuve au casino, Fujiko doit assumer sa dette. La veuve veut l’arme de l’homme qui a tué son mari, alors Fujiko se retrouve à la poursuite du tristement célèbre tireur Daisuke Jigen.

Les petits-enfants du roi d'Autriche montent à bord d'un train transportant des œuvres d'art de grande valeur. Pour approcher sa cible, Fujiko se fait passer pour Maria, leur tutrice. À bord, elle rencontre un mystérieux samouraï Goemon Ishikawa.

Lupin III a déclaré qu’il volerait le masque d’un célèbre chanteur d’opéra. L'inspecteur Zenigata prend note de ce défi et décide d'assister personnellement à la prochaine représentation du chanteur.

Alors que Lupin tente de courtiser Fujiko, elle lui parle d’un bijou au bas d’une pyramide en Égypte. Pendant ce temps, Jigen, qui est à court d’argent après avoir été arnaqué, part également à la recherche du bijou. Jigen se retrouve bientôt à se battre non seulement contre Lupin, mais aussi contre les différents pièges mis en place par les pillards pour le bijou également.

Fujiko est après un pendentif appartenant à une élève d’une école de filles. Pour se rapprocher de sa cible, elle se fait passer pour l’une des enseignantes de l’école.

Fujiko et Goemon sont impliqués dans une affaire qui pourrait très bien conduire à la Troisième Guerre mondiale.

La diseuse de bonne aventure Shitoto peut deviner la « date de décès » de n’importe quelle personne. Les victimes sont toutes d’anciennes connaissances de Lupin III. Jigen est engagé pour détruire la lithographie que Shitoto utilise pour lire la bonne aventure. Que réserve cette diseuse de bonne aventure pour le destin de Fujiko ?

Lupin et Jigen se retrouvent à s'occuper d'une jeune fille qui a été utilisée comme une œuvre d'art vivante, tout en échappant à Fujiko, qui veut désespérément la tuer pour des raisons personnelles.

Lupin enquête sur un groupe de hiboux qui désirent Fujiko et commence à en apprendre davantage sur le passé de Fujiko tout en luttant contre les illusions provoquées par une étrange drogue.

Alors que Goemon tente de s'occuper de Fujiko, Oscar se déguise en Fujiko et la fait accuser de divers crimes parfaits dans le but de gagner les faveurs de Zenigata.

Fujiko, Zenigata, Lupin et Jigen se rendent dans un étrange parc d'attractions pour affronter le passé de Fujiko et le comte dérangé Luis Yew Armied.

Fujiko entre dans une chambre où le comte Luis Yu Almeida est assis et l'attend, mais Lupin s'interpose depuis une salle de communication et se fait tirer dessus par Jigen, qui a inhalé la drogue de Fraulein Eule Cult, ce qui pousse Lupin à s'enfuir.