Saison 1

Un jet privé appartenant à une compagnie d'assurance s'écrase à proximité de Miami dans les Everglades. Huit personnes auraient péri sur le coup. Chef de la section scientifique de la police, Horatio Caine demande à son équipe de réunir au plus vite tous les cadavres. Les premiers examens démontrent que le pilote a été tué par balle. Plus tard, les policiers retrouvent vivant un des passagers. Il s'agit du PDG de la société...

Après que son mentor a perdu la vie en tentant de désamorcer une bombe, Horatio est déterminé à retrouver le coupable. Mais Megan doute de sa faculté à mener une enquête qui le touche de si près... L'équipe passe la zone au peigne fin et s'interroge. C'est alors qu'Horatio et Megan sont appelés à se rendre sur les lieux d'une autre alerte à la bombe...

Megan et Horatio découvrent une balle de revolver logée dans le torse d'un homme qui a été tué par un requin. Peu après, le corps d'un réfugié cubain est retrouvé sur un bateau à la dérive.

Un homme mort, avec une coupure à la gorge et le visage partiellement brûlé, est découvert sur la plage de Miami. A ses côtés se trouve une jeune fille inconsciente qui a été battue et jetée dans l'océan. L'enquête conduit Horatio à suspecter une importante famille de Floride et son patriarche, connu pour son inflexibilité. Ce dernier a déjà été mêlé dans le passé à une mystérieuse affaire qui a tourmenté Horatio pendant de longues années.

Un prêtre est assassiné. Les soupçons des enquêteurs se portent rapidement sur Cameron Medina, un jeune garçon de douze ans, présent sur les lieux au moment du drame...

Une fillette, âgée de cinq ans, est découverte assassinée dans les toilettes d'un parc d'attractions. L'équipe, qui subodore l'uvre d'un tueur en série, se mobilise pour le retrouver avant qu'il ne commette un autre crime...

Horatio et son équipe enquêtent sur la mort de Noel, un étudiant qui payait ses études en faisant du strip-tease. Le décès est intervenu au cours d'une «fête amazone», partie fine réservée exclusivement aux femmes. Horatio soupçonne un empoisonnement mais il peine à trouver le venin. L'autopsie est formelle : le jeune est décédé de mort naturelle... Parallèlement, Megan et Eric enquêtent sur la mort suspecte d'un plongeur, poignardé dans les eaux profondes...

Une mère de famille, son nouveau-né et deux de ses fils ont été massacrés à leur domicile. Seuls le père et un autre enfant ont survécu au carnage. Horatio et son équipe commencent par analyser le sang retrouvé sur les vêtements du jeune rescapé...

Trois personnes sont tuées dans le centre de Miami à l'heure de pointe. Horatio et son équipe se lancent sur les traces de l'assassin, qui a abattu ses victimes d'une balle entre les yeux. Horatio penche pour l'acte d'un tireur isolé. Peu après, une quatrième personne est exécutée de la même manière...

Un universitaire a été pendu à un arbre après avoir été longuement torturé. La victime donnait des cours sur la violence à travers les siècles et usait de méthodes d'enseignement peu conventionnelles. L'équipe pense que le professeur a été éliminé par l'un de ses élèves...

Le corps d'une jeune femme non identifiée est retrouvé près d'un centre de réinsertion. Horatio et son équipe se rendent sur les lieux du crime...

Une prostituée est découverte morte poignardée, sous le lit d'une chambre d'hôtel. Les premiers résultats de l'enquête laissent apparaître que le tueur a tenté de nettoyer la scène du crime et a lavé le corps de la victime dans la baignoire...

L'équipe enquête sur la fabrication de drogues mortelles et sur la mort d'une femme dans une maison pour personnes âgées

Un homme nu est trouvé mort dans son lit. Il semble qu'il n'ait pas supporté les multiples violences sexuelles dont il fut l'objet. L'équipe, en quête d'indices, se met à étudier avec précision le corps de la victime...

Un homme est découvert mort dans la rue. Pendant le transport du corps à l'institut médico-légal, Alex note la présence de profondes brûlures sur la main droite de la victime. Il pense que le défunt a manipulé une source radioactive...

L'équipe enquête sur la mort d'un Russe, poignardé à mort. Le seul témoin du crime était une stripteaseuse qui travaillait pour lui...

Horatio est appelé à témoigner dans une affaire de meurtre. Le suspect est le mari d'un membre du conseil municipal...

Une affaire de drogue se retourne contre les détectives chargés de l'enquête. Ces derniers sont, en effet, accusés d'être à l'origine du cas qu'ils doivent résoudre...

Le corps d'une femme est découvert au bord de la piscine d'un hôtel. Elle a été abattue de deux balles en pleine tête. Horatio pense que le criminel est un tueur à gages...

Un ancien escroc que Horatio avait fait envoyé en prison vient réclamer de l'aide suite à la disparition de son fils. En fouillant dans la chambre du garçon, les policiers trouvent de la marijuana et des munitions dans la cour arrière. Après avoir retrouvé le corps d'un autre jeune dans le cimetière, Horatio et son équipe entament une course contre la montre afin de retrouver le disparu en vie... Parallèlement, Speedle enquête sur la mort d'un homme, survenue par asphyxie. La petite amie de ce dernier, qui était présente au moment du drame, tente de faire diversion en draguant Speedle.